L'APECA travaille en collaboration avec la population de la région de l'Atlantique pour consolider le tissu économique des collectivités locales et renforcer la compétitivité de la région. L'Agence agit également de concert avec des partenaires gouvernementaux, le secteur privé, des établissements universitaires et des organismes non gouvernementaux pour favoriser les possibilités de développement économique et promouvoir l'innovation afin de répondre aux besoins des entreprises, des organismes, des personnes et des collectivités. Ces efforts s'inscrivent dans le cadre du mandat de l'APECA qui est de « favoriser le développement économique de la région de l'Atlantique et, tout particulièrement, d'accroître les revenus gagnés et les perspectives d'emploi dans la région. »

L'APECA met en œuvre et administre différents programmes pour atteindre les trois résultats stratégiques suivants :

Entreprises concurrentielles et durables au Canada atlantique, particulièrement celles de petite et moyenne taille : la principale activité de programme entreprise pour atteindre cet objectif stratégique est la suivante : favoriser le développement des institutions et des entreprises.

Dynamisme et viabilité des collectivités du Canada atlantique : les principales activités de programme entreprises pour atteindre cet objectif stratégique sont les suivantes : favoriser le développement économique des collectivités de la région de l'Atlantique, mesures d'intervention spéciale et programme d'infrastructure.

Politiques et programmes qui visent à renforcer l'économie de la région de l'Atlantique : les principales activités de programme entreprises pour atteindre cet objectif stratégique sont les suivantes : politiques, défense des intérêts et coordination.