L'Administration a un double mandat. Premièrement, elle doit assumer les responsabilités du gouvernement du Canada quant au pipe-line et faciliter la planification et la construction efficaces et rapides du pipe-line, en tenant compte des intérêts locaux et régionaux, surtout ceux des Autochtones. Deuxièmement, elle doit optimiser les avantages sociaux et économiques de la construction et de l'exploitation du pipe-line tout en minimisant les effets néfastes possibles sur les conditions sociales et environnementales des régions touchées le plus directement par le pipe-line.

L'Administration sert d'agence centrale par laquelle le gouvernement fédéral traite avec le groupe de compagnies Foothills, et communique avec les gouvernements provinciaux et territoriaux du Canada et le gouvernement des États-Unis. La Loi délègue à l'Administration maints pouvoirs de réglementation d'autres ministères et organismes fédéraux, exception faite des fonctions dévolues strictement à l'Office national de l'énergie et des fonctions que se partagent l'Administration et l'Office.